Es el eje rector del sistema estatal, conformado por los titulares o representantes de seis instituciones de gobierno y quien preside, cuya función es establecer, articular y evaluar las políticas públicas, procedimientos y principios entre los entes públicos para la prevención, disminución y combate a la corrupción.

El Comité Coordinador está conformado por:

 Presidente del Comité de Participación Ciudadana en turno.

 Titular de la Secretaría de la Contraloría General del Estado de Yucatán.

 Titular de la Auditoría Superior del Estado de Yucatán.

 Presidente del Tribunal de Justicia Administrativa del estado de Yucatán.

 Titular de la Fiscalía Especializada en Combate a la Corrupción.

 Presidente del Instituto Estatal de Transparencia, Acceso a la Información Pública y Protección de Datos Personales.

 Consejero del Consejo de la Judicatura del Poder Judicial del Estado de Yucatán.

El Comité Coordinador conjuga los esfuerzos particulares de cada una de las dependencias que lo conforman, mediante su coordinación, cooperación y comunicación, con la finalidad de lograr un combate a la corrupción más eficiente.

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